Pythonインストール
WindowsApps版ではなくて公式を使用する。この時の最新版(Stable)は3.8.5
https://www.python.org/downloads/release
Windows x86-64 executable installerをダウンロードした(python-3.8.5-amd64.exe)。
PATHにも加えてインストール
pipを最新版に
python -m pip install --upgrade pip
Pymolインストール
https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pymol
pymol‑2.4.0‑cp38‑cp38‑win_amd64.whlをダウンロードした
pip install pymol‑2.4.0‑cp38‑cp38‑win_amd64.whl
ついでにpymol launcherも
pymol_launcher‑2.1‑cp38‑cp38‑win_amd64.whl
pip install pymol_launcher‑2.1‑cp38‑cp38‑win_amd64.whl
起動
例えばCMDでどちらか
pymol python C:\Users\UserXXX\AppData\Local\Programs\Python\Python38\Lib\site-packages\pymol\__init__.py